在女方输卵管通而不畅和男方精子畸形率高的情况下，以下因素可能影响着床：

1. 输卵管问题

输卵管功能不全：即使输卵管通畅，功能不全仍可能影响受精卵的运输。

炎症或粘连：可能导致输卵管环境不佳，影响受精卵的着床。

2. 精子质量问题

受精能力下降：畸形精子可能难以成功受精，即使受精也可能影响胚胎质量。

胚胎发育异常：畸形精子可能导致胚胎发育问题，增加着床失败的风险。

3. 子宫内膜环境

内膜厚度不足：子宫内膜过薄可能不利于胚胎着床。

内膜炎症或病变：如子宫内膜炎、息肉等，可能影响着床。

4. 免疫因素

免疫排斥反应：母体免疫系统可能对胚胎产生排斥反应，影响着床。

抗精子抗体：可能影响精子和卵子的结合，进而影响胚胎质量。

5. 激素水平

黄体功能不全：影响子宫内膜的准备，不利于胚胎着床。

其他激素失衡：如甲状腺功能异常、高泌乳素血症等，可能影响着床。

6. 遗传因素

染色体异常：胚胎染色体异常可能导致着床失败或早期流产。

7. 生活方式和环境因素

压力：长期精神压力可能影响内分泌，进而影响着床。

不良生活习惯：如吸烟、饮酒、不健康饮食等，可能影响生殖健康。

应对措施：

医学治疗：咨询生殖医学专家，进行针对性治疗，如输卵管疏通、精子质量改善等。

辅助生殖技术：如体外受精（IVF）或卵胞浆内单精子注射（ICSI）可能是不错的选择。

生活方式调整：改善饮食、戒烟戒酒、减少压力等有助于提高受孕几率。

总结：

输卵管通而不畅和精子畸形率高可能从多个方面影响着床，但通过适当的医疗干预和生活方式调整，仍有机会成功怀孕。建议与专业医生详细讨论，制定合适的治疗计划。